沿襲冰凍組織空間轉(zhuǎn)錄組實(shí)驗(yàn)，Visium FFPE測(cè)序也需要對(duì)組織進(jìn)行切片，因此客戶提供樣本時(shí)，可以是前期保存的石蠟組織塊，或取新鮮組織用石蠟包埋。后續(xù)切片、質(zhì)控、RNA信息捕獲及文庫(kù)構(gòu)建和生信數(shù)據(jù)分析等工作，全部由烈冰完成，具體實(shí)驗(yàn)流程如下：

FFPE樣本切片厚度一般為5μm（區(qū)別于冰凍組織樣本的10μm），切片樣本大小不宜超過(guò)6.5mm × 6.5mm（載玻片的大?。龅牟糠譄o(wú)法被捕獲到，反而可能會(huì)影響其他樣本空間信息。

組織樣本太大怎么辦？可以根據(jù)不同病變區(qū)域分為多個(gè)樣本。例如，腫瘤組織可以分為中心/邊緣/正常組織進(jìn)行切片觀察。

另外，對(duì)每個(gè)FFPE樣本，都需要做FFPE貼片粘附性實(shí)驗(yàn)。通過(guò)切片脫蠟染色再?gòu)?fù)水，顯微成像觀察脫片情況，保證正式實(shí)驗(yàn)樣本切片能牢固的粘附在玻片上，防止后續(xù)實(shí)驗(yàn)過(guò)程中加各種試劑或洗滌浸水導(dǎo)致切片脫落。